Alonso de Estrada était né à Ciudad Real en Castille la Manche en 1470, d'une famille de la haute noblesse.
Après avoir servi en Frandres et en Sicile, et avoir été corregidor de la ville de Cáceres en Estrémadure, il fut nommé par Charles Quint en 1522, Trésorier Royal de la Nouvelle Espagne. Avec Gonzalo de Salazar comme factor, Rodrigo de Albornoz comme comptable et Pedro Almindez Chirino comme veedor, leur rôle était d'assister Cortés, ou mieux de faire contrepoids à son pouvoir grandissant.
En 1524, il remplaça Cortés dans ses fonctions, pendant son expédition au Honduras. Il supplanta Cortés dans son rôle de Gouverneur et de Capitaine Général de la Nouvelle Espagne entre 1526 et 1528. Durant ces années, il participa avec Diego de Mazariegos à la reconquête du Chiapas et à la fondation des villes qui sont aujourd'hui Chiapa de Corzo et San Cristóbal de Las Casas.
Il mourut au Mexique, en 1530.