La Conquête de l'Amérique a été rapide. On distingue le plus souvent deux périodes : La première est celle des voyages de découverte et se cantonne au bassin Caribéen ; cette période va de 1492 à 1518. La seconde est celle de la pénétration continentale, marquée particulièrement par les conquêtes du Mexique et du Pérou ; cette période va de 1519 à 1543.
La Conquête de l'Amérique a été rapide. On distingue le plus souvent deux périodes : La première est celle des voyages de découverte et se cantonne au bassin Caribéen ; cette période va de 1492 à 1518. La seconde est celle de la pénétration continentale, marquée particulièrement par les conquêtes du Mexique et du Pérou ; cette période va de 1519 à 1543.
Après 1543, l'Espagne organise ces territoires en vice-royautés, avec une organisation administrative, politique et judiciaire centralisées. C'est une période dite de pacification et de peuplement. Néanmoins, c'est seulement dans les années 1570, qu'une cédule de Philippe II interdira les actes de conquête proprement dite.
La première période est celle de l’implantation à Saint-Domingue (« La Española ») et de la découverte du bassin caribéen. A l’occasion de ses quatre voyages réalisés entre 1492 et 1504, Christophe Colomb avait découvert les îles, touché à l’Amérique du Sud à la pointe orientale du Vénézuela actuel (troisième voyage) et à l’isthme de Panama (quatrième voyage) jusqu’au Honduras actuel. Les Espagnols prirent pour base l’île de Saint-Domingue qu’ils exploitèrent largement à tel point qu’ils en épuisèrent rapidement les ressources, y compris humaines. En 1508, ils lancèrent des expéditions vers Cuba et Porto-Rico, en 1509 vers la Jamaïque. La même année, eurent lieu les premières tentatives d’implantation sur la Terre Ferme (« Tierra Firme »), sur la côte nord du continent sud-américain (actuelle Colombie).
Au cours de cette période, on assiste également aux premières tentatives infructueuses d’implantation en Floride. En 1513, Vasco Núñez de Balboa est le premier Européen à voir l’Océan Pacifique. C’est le départ de l’implantation à Panama suivie d’une lente pénétration vers le Nord de l’isthme.
La seconde période est celle de la pénétration continentale avec notamment la conquête de deux empires, le Mexique et le Pérou. De Cuba partiront les expéditions vers le Nord (Mexique et Floride). Panama sera le port de la Mer du Sud, qui portera les Espagnols le long des côtes occidentales du continent sud-américain. En 1536, par l’océan Atlantique, ils pénétreront dans le Rio de la Plata (Argentine et Uruguay). Ils remonteront les fleuves jusqu’au Paraguay.
A cette même époque, aura lieu la pénétration plus diffuse au cœur de continent, et des jonctions s’opéreront : Au Nord, les expéditions parties du Mexique rejoindront celles parties de Panama. Au Sud, les conquistadors partis de la côte caraïbe rejoindront ceux venant du Pérou pour découvrir le centre de la Colombie et de l’Equateur. De même la jonction sera faite entre ceux du Paraguay, du Pérou et de la Bolivie.
Du Pérou, ils découvriront le Chili. Et du Mexique partira dès 1527, la première expédition vers les Philippines, à travers l’Océan Pacifique.
La vice-royauté du Pérou fut créée par Charles Quint en novembre 1542. La guerre civile que connaissait le Pérou retarda sa mise en place réelle. Sa compétence à sa création couvrait tout le continent sud-américain.