Sebastián de Belalcázar ou Benalcázar était né en 1480, à Belalcazar, Province de Córdoba, en Andalousie. Son vrai nom était Sebastián Moyano. On ne sait pas grand chose de ses origines ni des conditions de son arrivée aux Indes. Selon certaines sources, il serait venu en Amérique dès 1498, lors du troisième voyage de Christophe Colomb, selon d'autres, en 1513, avec Pedrarias Dávila. Aussi bien Juan de Castellanos que l'Inca Garcilaso de La Vega, ne sont fiables en ce qui le concerne.
En 1522, il était installé au Panamá, et en 1524, il participa à la conquête du Nicaragua avec Francisco Hernández de Córdoba. Il fut par la suite alcalde de la ville de León. En 1527, il était au Honduras.
Il rejoint l'expédition de Pizarro vers le Pérou en 1531, préférant réunir sa propre troupe plutôt que de s'allier à Hernando de Soto, parti, lui aussi du Nicaragua. Il fut au Pérou, l'un des capitaines de l'expédition, bien que n'ayant jamais eu les postes prestigieux confiés à Hernando de Soto. Il participa à la bataille de Cajamarca et perçut lors de la répartition de la rançon d'Atahualpa 2 1/4 parts d'or et d'argent, soit 9909 pesos d'or et 407 2/8 marcs d'argent, soit à peine plus que la part d'un cavalier ordinaire.
Il s'éloigna rapidement des Pizarro, lorsque, après avoir été laissé par Pizarro, à la garde de la ville de San Miguel de Piura, il organisa pour son compte la conquête de Quito puis du Popayán. Pizarro tenta de contenir sa volonté d'indépendance, mais n'y parvint pas au delà de Quito.
En 1539, Benalcázar organisa une grande expédition au coeur de la Colombie, en quête comme tant d'autres du mythique El Dorado. Il parvint à Bogota où se trouvèrent avec la sienne, deux autres expéditions, celle de Gonzalo Jiménez de Quesada, et celle de Nicolás Federmann.
En 1540, il fut nommé gouverneur du Popayán, territoire aux contours imprécis entre Equateur et Colombie actuels. Il s'opposa à Pascual de Andagoya, en charge du territoire voisin de San Juan.
Lors de la guerre civile au Pérou, il fut plusieurs fois sollicité par les envoyés du roi d'Espagne, Blasco Núñez Vela, puis Pedro de La Gasca, chargés de soumettre les belligérants.
En 1546, il fit exécuter Jorge Robledo, à la suite de conflit sur des limites territoriales. Jugé pour cet acte qui fut considéré comme un crime, il fut condamné à mort, mais néanmoins autorisé à faire appel du jugement, en se rendant en Espagne. Il mourut de maladie en 1551, à Carthagène des Indes, pendant son voyage vers l'Espagne.
