Juan de Herrera était né vers 1513, à Trujillo, Province de Badajoz, en Estrémadure. De la même ville que les Pizarro, il avait été recruté par eux lors du voyage de Francisco en 1529. Il passa donc très jeune aux Indes, et participa à la conquête du Pérou.
Fantassin à Cajamarca, il perçut, malgré son jeune âge, 3/4 de part d'or et 7/8 de part d'argent, lors de la répartition de la rançon d'Atahualpa, soit 3385 pesos d'or et 158 marcs d'argent.
En 1535, il était de retour en Espagne. Il avait été chargé de transporter des sommes importantes pour la famille Pizarro. De ces sommes, il avait distrait la valeur d'un cheval qu'il avait acheté pour Juan Pizarro à Panama. A son arrivée en Espagne, la famille Pizarro exigea la somme, bien qu'il pût prouver la réalité de la dépense faite pour Juan Pizarro. Il resta fâché avec eux toute sa vie.
Il fut regidor de Trujillo en 1544, et était alcalde de la ville en 1577.
