Né à Séville vers 1497 dans une famille modeste, Francisco de Jerez (ou Francisco López de Xerez) passa aux Indes avec Pedrarias Davila en 1514, âgé seulement de 17 ans. En 1516, il accompagna Vasco Núñez de Balboa dans un voyage sur la côte du Pacifique, puis s'établit dans la ville d'Acla comme écrivain public.
Ami de Francisco Pizarro, il participa au premier voyage vers le sud en 1524, comme secrétaire de Pizarro et de l'expédition. Il participa également au second voyage de 1527, mais ne resta pas avec les Trece de la fama à la Gorgona. Malade et dénué de tout, il rentra à Panama avec Juan Tafur, bien que ne faisant pas partie de ceux qui avaient écrit au gouverneur de Panama depuis l'île du Coq (la isla del Gallo) en août 1527.
Il fit également partie de la troisième expédition, comme secrétaire. Présent à la bataille de Cajamarca, il perçut double part d'or et d'argent, plus 1/4 de part pour son travail de secrétaire (11100 pesos d'or et 456 marcs d'argent). Sa participation à la conquête du Pérou s'arrêta là, car, s'étant cassé une jambe peu après Cajamarca, il fit partie des premiers qui furent autorisés à quitter le Pérou dès 1533.
A son arrivée à Séville en 1534, il publia une chronique des événements intitulée Verdadera relación de la conquista del Perú y provincia del Cusco, llamada la Nueva Castilla.
Il eut des charges honorifiques à Séville, fit un beau mariage, et entreprit des opérations commerciales avec Panama et le Pérou. Il y perdit la fortune gagnée à Cajamarca, à tel point qu'en 1554, il voulut revenir au Pérou. On pense qu'il n'y revint jamais.