Manuel de Rojas y Córdoba, né vers 1476, était originaire de Cuéllar en Castille et León. Il passa à Cuba vers 1512 où l'oncle de son épouse, Diego Velázquez de Cuéllar était gouverneur. En 1516, il fut envoyé à la Cour avec Panfilo de Narvaez, pour présenter les requêtes de habitants de Cuba. Il aida le gouverneur dans ses luttes conte Hernan Cortés, et fut parmi les premiers conquistadors de la Jamaïque.
Après la mort de Diego Velázquez de Cuéllar, il fut nommé gouverneur de Cuba, charge qu'il occupa un an, jusqu'à la nomination de Gonzalo de Guzmán. Il occupa à nouveau ce poste entre 1532 et 1535.
Il passa ensuite au Pérou, où il retrouva son frère Gabriel de Rojas y Córdoba.
Il revint en Espagne où on a trace de son testament rédigé en 1561.