Diego Méndez de Segura était né en 1475, à Zamora, province du même nom, en Castille et León. A la mort de son protecteur, le comte de Penamacor, il entra au service des Colomb vers 1493.
Il participa au quatrième voyage de Christophe Colomb comme Secrétaire Officiel de l'expédition. Il est surtout connu pour son acation lors du naufrage que fit l'expédition le 25 juin 1503, devant la Jamaïque : Mendez de Segura réussit à faire la traversée de la Jamaïque à Hispaniola en canöe indigène. Il fut mal reçu par le gouverneur Nicolas de Ovando, chargé d'interdire à Colomb l'accès à l'île d'Hispaniola. Il consentit, compte tenu des circonstances, à autoriser Mendéz de Segura à se rendre à Santo Domingo, où il acheta un bateau, pour porter secours aux naufragés de la Jamaïque.
Le roi Ferdinand le Catholique, le décora pour ce haut fait, de l'Ordre de l'Eperon d'Or.
Lorsque Diego Colomb fut nommé vice roi de Hispaniola, en 1508, il revint dans l'île comme Secrétaire et Comptable de la colonie. En 1510, il reçut une encomienda de 80 indiens. En 1522, il fut nommé Alguacil Mayor de l'île.
Il mourut le 8 décembre 1536, à Vallladolid.
Il est auteur d'une chronique relatant le quatrième voyage de Christophe Colomb.