Juan de Barbarán était né vers 1500, à Illescas, ville située entre Madrid et Tolède. Il est connu au Panama dès le début des années 1520, puis au Nicaragua. C'est de là qu'il part en 1531, pour l'expédition du Pérou, avec les troupes de Sebastián de Benalcázar. Il participe comme cavalier à la bataille de Cajamarca, et sa part dans la répartition de la rançon d'Atahualpa, est de double part d'or et d'argent (8880 pesos d'or et 362 marcs d'argent).
Pizarro le nomme au cabildo de Jauja lors de la fondation de la ville en 1533, puis de Lima en 1538. Il fut très proche du clan Pizarro. Il accumula une fortune très importante, plus en liquide qu'en biens immobiliers, et devint prêteur sur gages dans tout le Pérou. Administrateur un temps, des biens des défunts, il semble qu'il ait pu commettre quelques indélicatesses que lui reprochèrent les héritiers avec lesquels il dut négocier.
En 1541, il pris la dangereuse responsabilité de procéder à l'inhumation de Francisco Pizarro après son assassinat. Il fut ensuite le tuteur de ses enfants. Il se distingua lors de la bataille de Chupas qui vit la défaite de Diego de Almagro el mozo. Il obtint ensuite une encomienda à Lambayeque, tout en continuant à résider dans celle qui lui avait été attribuée à Lima, privilège qu'il fut le seul à obtenir. Il se tint ensuite, à l'écart des affrontements qui opposèrent Gonzalo Pizarro au vice roi.
Il mourut des suites de blessures reçues lors d'un affrontement contre une communauté d'esclaves noirs marrons de la côte.
